高密度固相基因芯片 检测平台
百万级检测位点、高效率基因分型、数据出色、国产自主知识产权
加速生物育种进程 / 大幅降低育种成本,节省人力物力 / 实现选育决策精准、高效
基因科学助力农业振兴,打响“种业翻身仗”

基因科学“种子”是农业的芯片,关系国家粮食安全基础。从2021年我国出台《种业振兴行动方案》,到2023年中央一号文件再次强调“深入种业振兴行动”,种子安全被提升至空前高度。

“力争一年开好头,三年打基础,五年见成效,十年取突破,逐步实现种业科技的自立自强,种源自主可控。”

——《种业振兴行动方案》

从“经验育种”迈向“精准育种” 分子技术让“种业振兴”搭上快车道
育种1.0时代
农家育种
人类凭借经验驯化野生动植物。效率极低,依赖自然突变,受外部因素干扰大。
育种2.0时代
杂交育种
利用杂种优势培育改良品种。相较于农家育种,能极大改善作物特性,获得理想性状。但育种周期长,资源消耗大。
育种3.0时代
分子育种
利用生物技术,从分子层面筛选或叠加优良基因组合。极大提升育种效率,减少重复实验和资源消耗。
育种4.0时代
智能育种
在分子育种的基础上,利用大数据、人工智能等信息技术构建高效育种方案及预测模型。进一步提升育种效率,实现智能、高效、定向培育新品种。
目前,发达国家已经进入育种4.0时代,中国尚在2.0至3.0时代之间。分子育种是时代所需,形势所向,亦是中国种业奋起直追的“超车道”。
高密度固相基因芯片:基因分型“金标准”
高密度固相基因芯片(以下简称“固相芯片”)为基因分型提供了一套性价比更高、操作更便捷、具有高度准确性的高通量基因分型解决方案,适用于各种待检测位点已知的应用场景,被业内视为基因分型的“金标准”。
基因分型技术手段比较
固相芯片液相芯片低深度重测序
原理探针杂交及单碱基延伸利用探针捕获目标区域位点后,进行二代测序大幅降低测序深度(1X以下),通过算法进行基因型填充
可定制的 标记数量5K-1M5K-200+K不可定制标记,测序结果存在随机性,通过统计方法补齐数据
实验周期2-3天≥30天≥30天
定制周期芯片设计完成后,约6-8周即可交付6个月以上4个月以上
准确性平均检出率99%, 复现性99.5%;检出率70%-99%(与测序深度有关)检出率70%-99%(与测序深度有关)
知识产权已具备完全国内自主知识产权依赖二代测序技术平台依赖二代测序技术平台
检测成本单个样本检测成本随样本量增加边际递减,在大规模定制样本时更具成本优势。开发成本较低,但在大规模定制样本,超高通量检测情形下不具成本优势。成本随基因组大小的变化而变化,不适合基因组超大的生物体检测。
稳定性固相芯片的生产过程包含了对每一颗微球的多次质检,减小了批间差对检测结果的影响。检测数据质量与捕获探针试剂盒批间差相关;目标区域检出率存在随机性。目标区域检出率存在随机性。
应用方向
动植物 基因组研究:
1、基因——表型假说验证
用于精细性状定位和基因——表型假说验证,帮助科研人员验证目标性状相关的SNP位点,实现分子标记的筛选和性状定位。
2、全基因组关联分析
固相芯片检测位点可覆盖动植物全基因组范围内的关联定位,提供准确的遗传定位信息,助力全基因组关联分析。
分子育种:
1、分子辅助标记育种
固相芯片能够进行准确、高效、高通量的基因分型工作,帮助育种人员快速找到目的基因型,提高选育效率。
2、全基因组选择育种
育种人员可根据已筛选的关联位点,定制相应的固相芯片。检测数据可帮助育种人员建立高准确度的育种预测模型,检测流程便捷、高效。
品质检测:
1、种质资源基因型鉴定
固相芯片可以在基因水平上反映个体间的遗传差异,不受环境影响。固相芯片可以在基因水平上反映个体间的遗传差异,不受环境影响。
2、转基因检测
固相芯片可以精确检测出转基因成分,科学建立转基因标识制度和体系。
中国“芯”,先进,更安心

拉索生物高密度固相基因芯片检测平台由我司自主研发生产,打破了欧美长达二十年的技术垄断,实现了高密度固相基因芯片全部国产自主知识产权替代。产品涵盖高密度固相基因芯片、OmniScan高通量基因芯片扫描仪、配套试剂盒、软件及算法。

产品特色
高通量

1、采用先进的蚀刻工艺和微纳加工工艺,在载玻片大小的单晶硅板上集成千万到亿数量级别的微孔,每个微孔对应一个检测单元(BeadType),实现高通量基因分型检测。

2、单个样本可检测5,000 ~ 1,000,000个SNP位点。

高准确度

1、芯片生产过程包含了对每一颗微球的多次质检,以确保实验数据的准确与可靠。

2、基于高密度固相基因芯片(Microarray)独特的设计原理,每个检测位点均有多个微球重复,进一步提升检测结果的准确性。

3、自主研发的实验室信息管理系统(LIMS)能够全流程回溯实验,帮助实验人员更为准确、快速地排查实验中可能出现的问题。100%样本追踪功能,可帮助实验人员快速定位问题样本。

4、检出率(Call Rate)达99%,复现性(Reproducibility)达99.5%。

低成本

1、微米级检测单元,将海量检测位点集成在一张载玻片大小的芯片上,减少了试剂消耗。

2、实验人员在2-3天内即可完成一轮检测,无需繁冗的建库等前续步骤。

3、检测完成后,高通量基因芯片扫描仪可在短时间内直接生成基因分型检测结果,无需耗费大量算力及存储空间用于数据分析及保存。

可灵活定制

基因芯片的检测位点可根据客户需求灵活定制,且适用于任何物种。

国产化解决方案

1、自主研发并已获得专利授权,打破国外技术垄断。

2、主要供应商全部来自本土企业,产品供应不受国际环境影响。

3、本土技术团队提供全流程的客户支持与服务。

工作流程
检测实验所需时间2-3天
提取样本中的DNA
核酸 提取
将起始DNA扩增
扩增
将扩增后的DNA
酶切成片段
打断
通过沉淀、再复溶,
纯化和浓缩DNA
沉淀 &复溶
将完成处理的样本DNA
转移到芯片上与探针杂交
杂交
将探针进行碱基延
伸和荧光染色
延伸 &染色
OmniScan高通量基因
芯片扫描仪扫描芯片
扫描
生成检测结果
数据 处理
基因芯片定制流程与步骤
在最终完成芯片设计并获得确认后,约 6-8 周交付定制芯片。 定制完成后,后续每批从下单到交付时间约 1-2 周。
1、确定检测位点及探针设计:约2周

客户提供物种及定制位点列表,苏州拉索评估并确认。

根据定制位点,设计探针。

2、定制微球池(Bead Pool):约5~6周

制作微球池,生产测试芯片,反馈位点定制成功率。

3、生产芯片并交付:约1~2周

测试芯片结果确认后开始量产定制化芯片并交付。

规格参数
拉索生物高密度固相基因芯片
技术类型:高通量基因分型芯片
芯片尺寸:75mm*25mm
位点数量:可检测5,000~1,000,000个SNP位点
样本类型:毛发、血液、唾液、口腔拭子、其他物种的样本
可检测的突变类型:单核苷酸多态性 (SNPs),插入缺失 (Indels),拷贝数异常 (CNV)
核酸类型:DNA
储藏条件:2­℃-8­℃
保质期:12个月

基本参数

工作条件

OmniScan高通量基因芯片扫描仪
载片数:1
检测样本:1-24个样本
样本通量:每台芯片扫描仪可处理5,000-40,000样本/年(基于实验室及系统配置,扫描时间可能会有所不同)
荧光通道:红、绿
激发光源:长寿命免维护LED光源
图像分辨率(最高):4320*3420
聚焦类型:自动聚焦
聚焦范围:应不小于1007 um * 767 um
长x宽x高:244x244x200mm(可便携运输)
重量:10kg
医疗器械注册证:已获得
环境温度:10℃~30℃
环境湿度:≤80%
高度:海拔2500m以下
使用电源:220V~50Hz,1.62A

OmniScan高通量基因芯片扫描仪已于2022年8⽉获得医疗器械注册证。

其他说明
提供配套试剂盒,实验操作所需的设备 随OmniScan高通量基因芯片扫描仪配套提供。
技术支持技术支持
技术支持
周经理 +86-17315569619